El modelo científico-natural en medicina, a la vez que encerraba una "teoría" que consideraba como constituyentes del saber médico a la técnica y las ciencias naturales, excluyendo a otros saberes no experimentales; también se expresaba en una metodología anatomoclínica, fisiopatológica y etiopatológica que atravesaba la exploración, el diagnóstico y el tratamiento.
La inclusión de las ciencias humanas o sociales en medicina supuso de hecho una primer ruptura con aquella metodología tradiciona1 en 1a medida de que el paradigma de 1a neutralidad del científico comenzó a resquebrajarse al aceptar el papel de 1a subjetividad del observador en el conocimiento de 1a realidad. Posteriormente, con las humanidades médicas primero y finalmente con 1a bioética, se desarrollaron metodologías que comenzaban aceptando la pluralidad de puntos de vista en la consideración de los problemas de salud-enfermedad y a partir de allí, sobre una tradición especialmente filosófica, aportaron alternativas para una toma de decisiones que incluyera la consideración de principios éticos universales, las máximas morales tradicionalmente compartidas por las profesiones de la salud, el papel de las virtudes en el ejercicio profesional, así como la historia y tabla de valores propia de cada sujeto.
El método de la justificación moral por principios ampliamente difundido en la versión de Beauchamp y Childress, el método casuístico, los enfoques de la virtud y otros métodos diversos, encontraron así en el funcionamiento de los comités hospitalarios de ética uno de los mejores espacios para ser implementados.